除了巨噬細胞、中性粒細胞和自然殺傷細胞，免疫系統中還有一類蛋白質，稱作補體系統。雖然它們的作用不如細胞那么專業，但在免疫系統中的作用也不可忽視。補體系統是由近40種蛋白質組成的一個復雜的限制性蛋白水解系統，是存在于人和動物血液和組織液中的一組經活化后具有酶活性的特殊蛋白質，可輔助和補充特異性抗體，介導免疫溶菌、溶血作用，故稱為補體。它們相當于免疫系統中的工兵，雖然作戰能力不強，但不可或缺。

由于補體一直都存在于人體的血漿中，所以它可以隨時而迅速地起作用，但對于特定感染源的針對性較差。補體不僅能直接引起免疫反應，而且還是獲得性免疫被激活的重要中間物質。在實驗中，當補體或其他天然免疫系統缺失后，即便是接觸相同的感染源，一些原本能夠發生的獲得性免疫也沒有了。因此，補體在人體免疫反應中所起的作用是非常重要的。

根據功能不同，補體主要分為四組: 補體系統的固有成分、激活因子、受體以及活性片段。補體系統的主要生理功能是促進吞噬細胞的吞噬功能和溶解靶細胞，因此是機體免疫防御機制的重要組成部分，對消除外來抗原的傷害、維護機體內環境的平衡具有重要作用。其主要功能是：識別侵入的細菌等靶細胞并直接將其裂解；調理吞噬細胞某些補體的受體，使入侵的細菌與吞噬細胞表面的補體受體結合并被吞噬；當組織中有異物侵染時，補體結合到血液中表達補體受體的白細胞上，介導白細胞穿越血管壁，到達異物入侵部位，激活炎癥反應；識別機體內的抗原抗體復合物，并介導這些復合物到達吞噬細胞，使之識別并被吞噬清除。

研究證明，體外血清經殼寡糖處理能夠激活補體。日本東北藥科大學微生物學專業Suzuki等將人血漿與殼寡糖一起孵育20分鐘后，檢測到補體分子C3的活性隨殼寡糖主鏈的長度增加而增強，殼寡糖增強了補體C3的裂解能力及清除免疫復合物的能力，提高了機體的免疫防御功能。

     研究殼寡糖對整體動物免疫調節的功能影響發現，在動物腹腔注射殼寡糖能增強巨噬細胞的吞噬能力、中性粒細胞黏附細菌的能力、B細胞血清溶血素的釋放以及促進T細胞“玫瑰花環”的形成。不僅如此，殼寡糖還提高了免疫器官與身體的重量比，試驗動物的胸腺以及脾臟的重量都有顯著升高，對急性變態反應有著很好的緩解作用。殼寡糖對機體的免疫處于一個正調節的狀態，但同時殼寡糖還對風濕性關節炎等一些自身免疫疾病有一定的控制作用。這些免疫疾病的原因是因為自身免疫反應過度，而使用殼寡糖可以緩解這種過度的免疫反應。總之，殼寡糖對免疫系統防衛部隊的多個環節都有增強的作用，相當于提高整個部隊的作戰水平，因此可以說殼寡糖是一種非常好的免疫調節劑。